在进行原位修复时，施加的生物表面活性剂还可能会被吸附到土壤上，其也可能影响土壤的物理、化学和生物性质。生物表面活性剂的存在会减少土壤－水界面的表面张力，引起土壤孔隙内压降的变化，从而造成水和空气在土壤孔隙间分配的变化，最终改变土壤原有的物理性质和氧化还原条件，产生潜在的负面影响。有关表面活性剂与土壤环境相互作用的研究非常缺乏，但这是非常值得关注和深入研究的。

枯草菌表面活性剂（Surfactin），又称枯草菌酯肽，是一种由枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）产生的循环酯肽。它由与β-羟基-ω-甲基肉豆蔻醚酸以环状缩肽键连接的九肽组成，是另一类知名的有抗微生物成分的生物表面活性剂。

根据氨基酸序列的不同，将Surfactin分为三种类型：Surfactins A、B、C。在氨基酸位置上，Surfactin-A有L-亮氨酸，Surfactin-B有L-缬氨酸，Surfactin-C有L异亮氨酸，与氨基酸位置有关的内酯环由C14－C15β-羟基脂肪酸形成。枯草菌表面活性剂是一种高效的生物表面活性剂，仅含0. 005％枯草菌表面活性剂的0.l mol/L碳酸氢钠溶液的表面张力下降到27. 9mN/m。

进行原位修复时，生物表面活性剂的使用会对生活于其中的土著微生物种群产生一定的毒性和影响，此外由于其能被微生物降解，其代谢产物可能更具毒性。因此，生物表面活性剂的存在可能会会对环境造成一定的污染并增加了环境污染的负担。可见，加强生物表面活性剂对环境产生潜在的影响和其生物降解特性的研究，将为有效地控制生物表面活性剂造成的环境污染、合理利用生物表面活性剂，提供重要的科学依据。在进行现场表面活性剂增溶修复时，必须进行全面的生物表面活性剂毒性和环境危害性实验，确保生物表面活性剂使用安全。